Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP3P08254 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP3P08254 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP3P08254 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP3P08254 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP3P08254 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP3P08254 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP3P08254 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP3P08254 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP3P08254 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP3P08254 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP3P08254 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP3P08254 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP3P08254 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP3P08254 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP3P08254 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP3P08254 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms