Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCCAP05165 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCCAP05165 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCCAP05165 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCCAP05165 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCCAP05165 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCCAP05165 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCCAP05165 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCCAP05165 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCCAP05165 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCCAP05165 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCCAP05165 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCCAP05165 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms