Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC1P02654 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms