Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA1P02647 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA1P02647 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOA1P02647 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOA1P02647 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA1P02647 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms