Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFRP00533 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EGFRP00533 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EGFRP00533 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFRP00533 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFRP00533 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFRP00533 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFRP00533 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFRP00533 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFRP00533 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFRP00533 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFRP00533 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFRP00533 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFRP00533 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFRP00533 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFRP00533 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFRP00533 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms