Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL1O95922 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms