Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms