Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX6O95503 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX6O95503 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX6O95503 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX6O95503 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms