Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEBLO76041 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEBLO76041 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEBLO76041 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEBLO76041 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEBLO76041 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEBLO76041 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEBLO76041 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEBLO76041 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms