Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRMUO75648 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRMUO75648 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRMUO75648 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRMUO75648 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TRMUO75648 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRMUO75648 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRMUO75648 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRMUO75648 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRMUO75648 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRMUO75648 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRMUO75648 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms