Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GADD45BO75293 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms