Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBNO60934 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBNO60934 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBNO60934 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBNO60934 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBNO60934 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBNO60934 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBNO60934 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBNO60934 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBNO60934 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms