Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN3BO60391 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms