Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOX15O60248 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOX15O60248 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX15O60248 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOX15O60248 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX15O60248 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX15O60248 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX15O60248 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX15O60248 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX15O60248 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX15O60248 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX15O60248 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms