Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP9BO43861 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms