Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDIL3O43854 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms