Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP2AO43633 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP2AO43633 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms