Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms