Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTIFO43310 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTIFO43310 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTIFO43310 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTIFO43310 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTIFO43310 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTIFO43310 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTIFO43310 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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