Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRXO43186 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRXO43186 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRXO43186 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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