Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN3O15551 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN3O15551 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms