Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRTO14522 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
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