Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIP1O00291 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIP1O00291 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIP1O00291 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms