Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms