Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E5RI56 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E5RI56 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E5RI56 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E5RI56 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E5RI56 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E5RI56 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E5RI56 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms