Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTL1A6NKG5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RTL1A6NKG5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms