Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms