Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms