Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND3A2RUS2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms