Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRMD3A2A2Y4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1264.3 ms