Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.3 ms