Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms