Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R4GMQ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R4GMQ9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
R4GMQ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms