Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms