Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLIC4Q9Y696 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms