Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARP1Q9Y4F1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARP1Q9Y4F1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms