Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF330Q9Y3S2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF330Q9Y3S2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF330Q9Y3S2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF330Q9Y3S2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF330Q9Y3S2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF330Q9Y3S2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF330Q9Y3S2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF330Q9Y3S2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF330Q9Y3S2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms