Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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