Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms