Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF5Q9Y2D1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF5Q9Y2D1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF5Q9Y2D1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms