Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUDCQ9Y266 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDCQ9Y266 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms