Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms