Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP1Q9UPQ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP1Q9UPQ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms