Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNRF3Q9ULT6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms