Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms