Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AKAP11Q9UKA4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AKAP11Q9UKA4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AKAP11Q9UKA4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AKAP11Q9UKA4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AKAP11Q9UKA4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AKAP11Q9UKA4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AKAP11Q9UKA4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AKAP11Q9UKA4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AKAP11Q9UKA4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms