Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms