Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms