Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPC1L1Q9UHC9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPC1L1Q9UHC9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms