Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5BQ9UGL1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
KDM5BQ9UGL1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5BQ9UGL1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms